В селе Эпкин Чуйской области вместе росли четверо мальчишек. Один, Алиаскар Токтоналиев, стал самым молодым министром республики и двадцать пять лет возглавлял Минфин, другой, Асанбек Токомбаев, секретарём ЦК по идеологии, третий, Самаркул Рыспаев, начальником Управления исполнения наказаний. Четвёртым был Айдаркан Молдокулов 3.
Родился 1 мая 1930 года в крестьянской семье 1. Школу-интернат окончил с золотой медалью, в 1951 году с отличием выпустился из Ташкентского финансово-экономического института 12. Началась карьера в финансовых органах, но через несколько лет он бросил всё ради науки: уехал в Москву, в аспирантуру Института экономики АН СССР. Научными руководителями стали член-корреспондент АН СССР Александр Ноткин и профессор Раиса Лившиц; с обоими дружил до конца жизни 23.
После защиты кандидатской Молдокулов вернулся во Фрунзе. Прошёл путь от младшего научного сотрудника до директора Института экономики АН Киргизской ССР, которым руководил семнадцать лет 12. Позже стал вице-президентом Академии наук, курировал все общественные науки: историю, философию, право, языкознание 12.
Главный научный прорыв: он первым стал искать экономическую мысль кыргызов не в трактатах (их не существовало), а в фольклоре. Проанализировал с экономической точки зрения песни Токтогула Сатылганова, пословицы Тоголока Молдо и средневековый трактат «Кутадгу билиг» Жусупа Баласагына. Вместе с академиком Тураром Койчуевым подготовил статьи для Большой советской энциклопедии 45.
Под его руководством вышла шеститомная серия монографий по региональной экономике Киргизии: от использования ресурсов до промышленных комплексов и внедрения научно-технического прогресса. За эту работу получил Государственную премию имени Токтогула 56. Монография «Экономические проблемы развития и повышения эффективности промышленного производства» (1973), на которой защитил докторскую, по оценке коллег не потеряла актуальности до сих пор 4.
Молдокулов превратил институт в образцовый научный центр. Всего опубликовал более ста двадцати научных трудов, шесть монографий 5. Воспитал десятки кандидатов и докторов наук. Коллеги из соседних республик считали его частью «знаковой четвёрки» среднеазиатских экономистов: Ибрагим Искендеров из Узбекистана, Рашид Рахимов из Таджикистана, Туймебай Ашимбаев из Казахстана 36.
Характер спокойный, ровный. Со всеми сохранял доброжелательные отношения, никогда не выходил из себя 5. Коллеги отмечали исключительную скромность и тонкое чувство юмора. Умел рассказывать анекдоты так, что смеялись все 57. О том, что он пишет стихи, многие узнали только после его смерти. Философская лирика о любви, дружбе и родной земле. Сыновья вместе с друзьями издали их посмертным сборником 57.
Жена Шайгуль Исыкеевна, трое детей: два сына и дочь. Все стали экономистами. Сын Сабырбек позже возглавил Кыргызскую ассоциацию страховщиков 67.
Молдокулов умер в 1986 году. На доме по Чуй, 243 / Исанова, 94, где он жил с 1967 по 1986 год, установлена мемориальная доска 47. Его именем названы улица в Бишкеке и две школы, одна из них в родном Эпкине 7. С 1990 года каждые пять лет проходят научные конференции, посвящённые его работе 17.