В ноябре 1938 года тело председателя Совнаркома Киргизской ССР сбросили в печь для обжига кирпича в Чон-Таше вместе со 137 другими расстрелянными. Баялы Исакеев четыре года поднимал республику из нищеты, построил первую железную дорогу, открыл три вуза и поднял грамотность с 3% до 60%. Систему он выбрал сам, система уничтожила его 58.
Родился в сентябре 1897 года в селе Кочкор Семиреченской области, по другим данным в Учекинской волости Нарынского уезда 12. Семья кочевая, бедная: отец занимался скотоводством и земледелием, умер, когда сыну было три года. Воспитывал дед Исаке, крестьянин-середняк, совершивший хадж в Мекку 123.
Сельскую школу окончил рано, в 1916 году завершил русско-туземную школу в Нарыне. Тогда же, девятнадцатилетним, участвовал в восстании и бежал в Китай. Через четыре года вернулся и вступил в партию. Двадцатые годы провел на курсах партийных работников в Ташкенте и Москве 136.
С марта по ноябрь 1927 года работал ответственным редактором газеты «Эркин-Тоо» («Свободные горы»), ведущего печатного издания на кыргызском языке. Продвигал ликбез, писал о подготовке к коллективизации 46.
Пост председателя Совнаркома получил в 1933 году после того, как предшественника Юсупа Абдрахманова сняли за «провалы коллективизации». Именно Абдрахманов советовал Исакееву наладить связь с Тураром Рыскуловым, заместителем председателя СНК РСФСР. Тесно сотрудничал с Торокулом Айтматовым 256.
За четыре года построил железную дорогу Фрунзе, Токмок, Рыбачье, проложил автомобильные тракты на Ош и Торугарт. Открыл три первых вуза, где училось больше тысячи студентов, театры, филармонию. Грамотность населения выросла с 3% до 60% к 1935 году 36.
Эпос «Манас» поднял на государственный уровень лично. Исакеев вошёл в редколлегию, инициировал литературную обработку части «Великий поход». Декабрь 1935 года: при его участии прошла первая всесоюзная конференция по манасоведению. С мая по сентябрь 1937 года по совместительству возглавлял Комитет науки при Совнаркоме 67.
Коллеги называли его «беспокойным руководителем»: энергичный, с привычкой к постоянному самообразованию, с хорошими ораторскими способностями. Ставил перед Москвой неудобные вопросы, чем вызывал раздражение союзных партийных боссов. Исключён из партии, арестован, расстрелян в ноябре 1938 года. Тело вместе с останками 137 других репрессированных сброшено в печь для обжига кирпича в Чон-Таше 58.
Исакеев был трижды женат: Калия (упоминается в документах 1924 года), Надежда Щеглова (Фрунзе), Муслима Байгалина (Алма-Ата). После расстрела Надежду и Муслиму арестовали; Муслима умерла вскоре после выхода из тюрьмы. Дочь Лариса, родившаяся в 1934 году, попала в детский дом под Алма-Атой. Выжила, впоследствии стала заслуженным деятелем культуры Кыргызской Республики 8.
Останки нашли и перезахоронили с государственными почестями в 1991 году. Место расстрела, село Чон-Таш в 25 километрах к югу от Бишкека, в 2000 году превратилось в мемориальный комплекс «Ата-Бейит» («Кладбище отцов»). Там же музей памяти жертв репрессий: материалы об Исакееве, Абдрахманове, Тыныстанове, Айтматове. Отдельный памятник стоит в Чолпон-Ате 15.
Архивы сохранили его машинописные автобиографии 1929 и 1937 годов, где он описывает потерю семьи, участие в восстании 1916 года, бегство в Китай. Научная статья А. Кунтубаевой доступна на «КиберЛенинке»; на кыргызском выпуск «Азаттык үналгысы» «1937: Баялы Исакеев: Системанын ишеничи жана курмандыгы» 68.